Test außer Betriebssystem wäre in diesem Fall hilfsreich.
Erstelle einen Linux Live-USB-Stick. Die Anleitung dazu findest du hier: http://bit.ly/1rNAOZn
Dann boote (nicht installieren) für Testzwecke von diesem USB stick, teste bitte den USB 3.0 Anschlüsse mit mehreren in Linux. Nach diesem Test können wir mit Sicherheit sagen, ob das Problem in Windows oder in Hardware steckt.